Ada dua metode untuk memulai program secara otomatis saat boot ke Windows 3.11.

Pertama, buat ikon untuk apa yang ingin Anda mulai. Atau, salin ikon apa yang ingin Anda mulai, dan letakkan di grup startup di Program Manager. Apa pun di grup startup akan secara otomatis memulai ketika Windows mulai setiap kali.

Atau, dari MS-DOS, dengan mengetik win Anda dapat menambahkan program yang ingin Anda jalankan setelah perintah. Misalnya, mengetikkan win notepad akan menjalankan Windows dan meluncurkan notepad secara otomatis.